从古代开始军旗是军队行军方向、指挥机关所在地等等的代表，军旗哪里部队的方向及灵魂就在哪里。
现在军旗被赋予更多精神内涵，旗帜不倒，部队的精神就不倒，战士就能坚持作战，尤其是一些被赋予了特殊荣誉的部队，更视旗帜比生命更珍贵，士气更盛，敌人看到更加害怕。
战斗中军旗立于己方高处，便于被己方士兵看到，鼓舞己方士气，对敌人也是震慑作用。
在战斗中夺取军旗不一定就能获得战斗的胜利，但是会非常影响敌人的士气，甚至导致敌人溃散。旗帜被夺取是部队的耻辱，考虑不好的影响，一般会裁撤该部队。
现代战争中军旗的作用已被削弱，因为战争模式从阵地攻防形式变成了远程打击，并且旗帜会暴漏部队的兵种、强弱、本方部署等等情报。
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