动物的根和实菌也有共生关系，和实菌共生的根称为菌根。外生菌根(Arbuscularmycorrhizae）：实菌的菌丝在根的外表构成菌丝体包在幼根的外表，有时也侵略皮层细胞间，但不进进细胞内，此时以菌丝取代了根毛的功用，增加了根系的吸收面积，如松等；
内生菌根(endomycorrhizae）：菌丝通细致胞壁侵略到表皮和皮层细胞内，加强吸收机能，促进根内的物量运输，如柑橘、核桃等；
表里生菌根：也有菌丝不只包在幼根外表同时也深进到细胞中，称表里生菌根，如苹果、柳树等。
菌丝吸收水分、无机盐等赐与动物，同时产生动物激素和维生素B等促进根系的生长；动物赐与实菌糖类、氨基酸等有机养料。
能构成菌根的高档动物2000多种，如侧柏、毛白杨、银杏、小麦、葱等；
具菌根的动物在没有实菌存在时不克不及一般生长，因而造林时须事先接种和传染所需实菌，以利于荒地上胜利造林。
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