毫无疑问，树的根系、四周的土壤以及微 看菌群之间的关系是很复杂的，需要考虑到许 多因素——物理的、化学的和生物的。如今，研究所谓的根围（即指土壤中围绕动物根系的 一个区域）才刚刚起头，然而人们已经很清晰地熟悉到树根和土壤微生物之间的关系不只复 杂并且重要逐个从某种水平上说，对相邻的树的根系也是如斯。
或许人们对那些共生关系研究最清晰、了 解最全面的就是树根和菌根之间的关系——土 壤实菌在落叶层、土壤和树根之间饰演效感化的角色。那种关系以菌丝套或菌丝的形式表现， 菌丝储蓄积累起来构成菌丝体并包住许多幼嫩的小根，侵袭根的皮层系统的细胞间隙。小根遭到 实菌侵袭的刺激而分枝，酿成珊瑚状。
苏格兰 松和欧洲山毛榉树是最有名的例子，但是那种现象在树根系中长短常普及的。实菌和宿主树 似乎都从那种共生关系中获益，后者通过增加的容量吸收菌根传递的必然量的营养物量。 桤木（桤树属）的根表示出另一种有趣的的形态，动物学家在读了如许的专业描述之后, 脑海里立即就能构成树叶外形和特征的清晰印 象。
有些热带树的叶子特殊大，例如藤春属， 那是热带西非一种有名的丛林树种，它的树叶长度可能超越1米，宽度也与此相当；许多单 子叶动物同样也长出浩荡的树叶，例如香蕉树以及棕榈树。协做，它的根系与固氮微生物有关，然而我们对 固氮微生物的特征却不甚了然，因为到目前为 行还不成能在地道的培育提拔情况中培育提拔它。
目前有几个树种涉及到弗兰克氏菌，可能与丝状细菌 有关，有时候喊做放线菌（放射菌类)。类似的 关系也会呈现在其他完全不相关的树种上，最有名的可能就是那些豆科动物的根上的根瘤—— 和它们有关的微生物是细菌，属于根瘤菌。
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