净觉寺占地面积1.854万平方米,共5个院落,建筑大部分集中于中院,并以主体建筑为中轴,左右分布对称合理。主要建筑有3殿3楼,即门殿、正殿、后殿;碑楼、钟楼、鼓楼。此外,还有东西配殿、龙凤门楼、智然墓碑亭以及耳房、配房共计98间。