十六强比赛将分东亚和西亚分别作赛，采取单场淘汰制。
当8强产生后，将重新抽签决定对阵，8强及半决赛采取主客场两回合淘汰制，而决赛将采取单场淘汰制。
亚冠杯决赛单场定胜负，固定在日本东京的国立竞技场进行，若双方于90分钟法定时间内打平，需完成上、下半场各15分钟的加时赛，若仍未分出胜负则进行点球大战。
2012年亚冠联赛 亚联杯8强抽签将于6月14日在AFC总部吉隆波进行，具体时间请留意当天媒体报道
2012亚冠四分之一决赛第一回合：2012年9月19日
2012亚冠四分之一决赛第二回合：2012年10月2日or3日
2012亚冠半决赛第一回合：2012年10月24日
2012亚冠半决赛第二回合：2012年10月31日
2012年亚冠决赛 2012年11月9日or10日 比赛地（待定）
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