左宗棠和李鸿章在新疆地区发生了严重的争执。在第二次鸦片战争期间，清朝政府与俄国签订了不平等条约——《北京条约》。这条条约让中国失去了大量的领土，并承认了俄国在新疆地区的势力范围。在这之后，李鸿章试图通过武力收复被俄国侵占的土地，而左宗棠则坚持和平谈判，并最终获得了新疆的完全控制权。可以说这次争执是导致两国关系紧张的主要原因之一。
他们在镇压太平天国运动的过程中建立了深厚的友谊，但在清朝统治者面临太平天国起义威胁时，两人再次发生了矛盾，左宗棠力主恢复对新疆的控制，认为这是抵御外国入侵的重要途径，李鸿章却认为没有必要把注意力放在新疆的问题上，他认为加强沿海防御才是最重要的。
在与法国签订《马关条约》后，李鸿章还对左宗棠提出了不同的意见，他认为，虽然中国已经被迫割让了一些领土，但这并不意味着中国已经被打败，相反，他主张继续维护中国的主权和尊严，反对西方列强瓜分中国的领土。
尽管如此，两人在不同问题上的观点仍然存在分歧，导致他们的关系变得紧张，尤其是在新疆问题上，两人的观点严重冲突，最终导致了他们的彻底决裂。
左宗棠和李鸿章是中国近代史上非常重要的两位重要人物，他们对中国的历史进程产生了深远的影响，并为当时的中国政府和人民带来了巨大的挑战和困难，正是由于他们的分歧，使得中国能够更好地应对这些挑战和困难，为自己的发展和繁荣奠定了基础。
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