《搜神记》次要内容是记载鬼神怪魅，做者著此书的大旨在于“创造神道之不诬”，该书是较早集中记述神话传说、俗闻逸事的专书，共搜集故事464篇。书中故事大都源于神话传说、宗教演义和民间传说风闻，固然虚妄荒谬，却也各有理寓。讲忠孝节义的，反映儒家概念；讲仙人术数的，植根道教思惟；表示因果报应的，源于佛学目标；惩恶惩恶则是三教殊途同归的目标。
若是我们撩开其鬼魅世界的奥秘面纱，能够窥见民俗风情，能够领会世道人心。书中有良多鬼故事：有的写人鬼相恋，如卷十六《紫玉》、《附马都尉》、《汉谈生》、《崔少府墓》等，那些故事或者反映帝王扼杀自在爱情的专造，或者反映女子对婚姻和生儿育女的巴望，都写得情节盘曲，楚楚动听；有的写鬼扬善惩恶，如卷五《赵公明参佐》中勾魂使者徇情枉法，放还阳寿已尽的高官王佑，阴曹使者密意地述说放他生还的理由，“卿位大常伯，而家无余财。
向闻与尊夫人辞诀，言辞哀苦。然则卿国士也，若何可令死？”又如卷十七《倪彦思》中，鬼怪痛斥前来驱鬼的典农：“汝取官若干百斛谷，藏著某处。为吏污秽，而敢论吾！”那贪官污吏被揭疮疤，立即“大怖而谢之”，民怨沸腾；有的写不怕鬼的故事，最出名的是卷十六的《宋定伯》，宋定伯不怕鬼而能造鬼获利，很耐人寻味。
称道英雄人物的瘭然正气与鄙视鬼神魔鬼是本书的主题之一，那类做品中传颂最广的是卷十九的《李寄》。无能昏官年年搜求童女祭祀巨蛇，巨蛇先后吃掉九个女孩。童女李寄毛遂自荐，愿做祭品，设法将巨蛇杀死。李寄的智勇双全，令人钦敬。
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